Die Malgersdorfer Meier-Orgel weist nach Jahrzehnten intensiver Nutzung mehrere substanzielle Schäden auf. Besonders betroffen ist die elektrische Anlage: Die Verkabelung entspricht nicht mehr den heutigen Sicherheits- und Schutzvorgaben. Mehrere tausend Leitungen und Kontakte müssen daher vollständig erneuert werden, um einen zuverlässigen und sicheren Betrieb wiederherzustellen.

Neben einem nach 50 Jahren erwartungsgemäß hohen Verschmutzungsgrad zeigen sich an Teilen des Pfeifenbestands, insbesondere bei Holzpfeifen, zudem Feuchte- und Schimmelspuren. Diese beeinträchtigen nicht nur das Material, sondern können langfristig auch die Klangqualität und Stimmhaltung der Pfeifen schädigen. Eine fachgerechte Reinigung und konservatorische Behandlung ist deshalb dringend  notwendig.

Im Zuge von Renovierungsarbeiten an der Orgel soll außerdem eine behutsame klangliche Nachjustierung erfolgen, damit das Instrument die heutige Chor- und Gemeindearbeit optimal unterstützt. Ziel ist keine stilistische Veränderung der Orgel, sondern eine sorgfältige Anpassung innerhalb ihres bestehenden Klangcharakters.